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第十二使徒VS初号机、零号机和光之巨人的好戏在第三新东京市隆重上演，NERV总部基地却发现了更坏的情况。
一个技术员大声惊叫起来：“警报！东面海上出现新目标，特征识别为......EVA！！！是九台EVA！！！”
“什么？！！”
“难道是其他国家的NERV支部来支援我们了？”
“别傻了！NERV各地的支部根本就凑不出九台EVA！不过如果它们来了，这位使徒一定会被歼灭的！！！”
一时间，大部分人都高兴的议论起来。
这个时候，碇源渡沉声说出了令所有惊讶的无以复加的话来，“你们高兴的太早了！这些EVA的敌人是我们！！！”
“什么？！！”
这个消息实在太过具备冲击性，所有人都不由自主的愣住了。他们一直以为EVA是自己这边的王牌，却没想到有一天自己会被这些王牌反过来对付。而且，他们想不出自己会被针对攻击的理由。
冬月幸增脸不红气不喘的说道：“这些EVA是SEELE暗中制造的量产型EVA，身上搭载使徒才有的核心，拥有无限动力，不需要脐带电缆，也没有活动极限，拥有惊人的恢复能力。根据我们得到的情报，SEELE高层认为我们保存的使徒莉莉丝应该被消灭掉，准备放弃我们了。”
葛城美里难以置信的问道：“放弃是指......？”
“把NERV总部和使徒一起消灭掉，这些量产型EVA的目的就是这个。”碇源渡沉声说道，“我们原本以为这个情报是错误的，没想到SEELE真的这么做了。各位，如果不想被消灭掉的话，我们必须要做点什么了。”
“......”
所有人都没有吭声。
他们原本以为敌人就只有使徒而已，却没想到使徒还没消灭掉，自己却先成了同胞攻击的目标。
救世主一瞬间成了人类的敌人？
开什么玩笑！！！
赤木律子转头看着碇源渡：“碇司令，现在我们该怎么办？”
“初号机和零号机的任务不变，和光之巨人配和消灭掉第十二使徒。由二号机出面拖延住量产型EVA，等第十二使徒歼灭掉以后，集中兵力歼灭量产型EVA。”碇源渡语气平淡的说道。
“就算是量产型EVA，造价也绝对不便宜，只要打退这九台量产型EVA，我们就有和SEELE高层对话的勇气了。”冬月幸增补充道。
葛城美里咬牙道：“可是这样做，二号机......”
“你还有更好的方法吗？”碇源渡冷冷的质问道。
“或许......我们可惜请哪位柳洞先生帮忙？”
冬月幸增说道：“他现在不在基地了。刚刚帮忙恢复基地供电以后，他就离开基地，不知道去哪里了。”
碇源渡逼视着她，“你还有什么要说的吗？”
“......没了。”
“那就下达命令吧。”
这也是没有办法的办法了！葛城美里一咬牙，命令道：“地面部队集中将武器对准东面的九台量产型EVA，二号机负责拦截它们。注意，明日香，你只需要拖住它们就行，不要太勉强自己了。”
“你真啰嗦啊，美里！”明日香不耐烦的嘀咕一声，紧急抢修工作进展的还不错，已经勉强能够投入到战斗中了，“我早就看那些冻结我二号机的家伙们不爽了！这一次正好给他们点颜色看看。”
“......小心点！”
“嗯！”